案例 | 奔曜科技携手库卡,以智能自动化技术加速药物靶点发现
蛋白组学作为一种研究蛋白质表达、修饰和功能的科学,蛋白组学已经被广泛应用在制药领域中,特别是在药物靶点分析方面。
通过蛋白组学研究,科学家们可以识别出与药物结合的特定蛋白质,了解这些蛋白质在疾病中的作用,以及它们如何被药物影响。其研究过程包括细胞培养、药物处理、蛋白提取等。这个过程非常繁琐,对于经验和操作稳定性要求非常高。
目前有大量的药物靶点机制未被探明,其原因在于现有靶点发现/鉴定技术尚未高通量化。利用自动化设备来制备蛋白组学样品,可以大幅提升实验效率、样品通量、数据准确性和可重复性。
本案例中,奔曜科技通过提供蛋白提取自动化解决方案,协助国内某生物技术公司完成药物处理后细胞样品的裂解、蛋白提取、蛋白定量和化学交联等实验流程,以便后续作进一步靶点蛋白纯化处理。自动化系统使整个蛋白质组制备流程标准化和可重复,为客户快速发现创新靶点和开发新药提供有力保障。
现有挑战
目前,蛋白组学流程高度依赖人工,操作周期较长。
同时,不同实验人员存在个体操作差异,一致性较差,数据可重复性较低。特别是在超声破碎、BCA鉴定等流程中,可能引入变量,导致蛋白提取及浓度均一化流程受到影响。
解决方案
为自动化完成细胞内蛋白提取、BCA法定量蛋白、化学交联等关键步骤,奔曜科技研发设计出蛋白提取自动化工作站。
蛋白提取自动化工作站配置有库卡KR 6 R700-2机器人、恒温混匀仪、超声破碎仪、高速离心机、移液工作站、酶标仪、耗材堆栈等仪器和模块。
其中,库卡KR 6 R700-2是KR AGILUS系列的紧凑式六臂机器人,额定负载3kg,臂展706.7mm,重复定位精度达±0.03mm,行业应用十分广泛。
在库卡机器人的辅助下,蛋白提取自动化工作站不仅可以完成细胞或菌体超声破碎、高速冷冻离心、BCA法浓度鉴定等蛋白表达鉴定的样品前处理程序,还可用于单克隆抗体、肽抗生素、疫苗、酶及多肽药物的发现和早期表达筛选。
为了更好地进行系统整合,软件层面,奔曜科技自主研发的自动化平台软件Bioyond Studio® 既能与底层仪器设备及自动化模块无缝连接,实现样品全流程可追溯,也能将实验数据上传至上层实验室信息管理系统(LIMS)。
Bioyond Studio® 内置实验流程管理、仪器管理、物料管理、运行监控等功能模块,研发过程遵循GxP标准,软件数据遵循FDA 21 CFR Part 11法规,确保系统的安全性、可用性与合规性。
硬件方面,蛋白提取自动化工作站通过智能调度库卡机器人,代替人工完成低温存储箱、移液站、超声破碎仪、离心机、酶标仪等不同单元模块之间的物料转运,在实现过程自动化的同时,达到提高效率、节省劳动力,以及保证数据的准确性、一致性与稳定性的目的。
除了兼容主流品牌仪器设备,奔曜科技根据实验流程需求,研究开发出全自动离心管开关盖机和大容量全自动低温存储箱。
其中,离心管开关盖机单次可完成10个以上的离心管开/关盖。全自动低温存储箱提供30个板位,存放试剂及微/深孔板,可满足全天候高通量实验需求。
客户价值
▶ 无人值守自动化
通过库卡机器人串联工作站内各仪器和功能模块,完成物料转运
人工参与度低,上样一次,每批次36个样本可实现2.5至5小时(根据不同实验流程)无人值守自动化运行
▶ 一致性高
采用移液站等高精度设备进行移液、加液操作,保证液体体积一致性
通过Bioyond Studio® 排程调度,严格控制步骤时间,保证关键步骤时间一致性
▶ 拓展性强
可基于标准产品,结合应用通量需求及功能需求,进行定制化扩展
实验测试
实验环境及条件
温度 | 24-28℃ |
湿度 | 85-95% RH |
试剂 | Triton-X100等 |
以下实验结果仅为离散测试参考结果,产品实际使用效果视具体情况而异
实验数据
本次实验采用的细胞样本均为HEK293,细胞数量约为10⁷
如下图所示,标准曲线y = 0.00163772x + 0.0128669 ,R²=0.997,满足实验要求R²≥99%
如上图所示,标准曲线及样本复孔之间CV值均≤10%,满足实验需求。其中,FGH行是ABC行的对应复孔。